أهداف الأسطول البحرى الجزائرى هو حمايه المياه الاقليميه الجزائريه من الأعداء فى حاله الحرب وفى حاله السلم فإنه يقوم بتنظيم حركه السفن المارة فى المياه الاقليميه الجزائريه فلا يسمح لها بالمرور بدون ترخيص كما أنه يساعد السفن فى حاله الخطر او الغرق وانقاذها وانقاذ الركاب.
