السبب في تنوع استخدامات المجاهر هو تنوع انواع المجاهر حيث يوجد اربعه انواع من المجاهر لكل نوع استخدامه كالاتى :
المجهر البسيط حيث يكبر العينة 200 او 300 مرة
المجهر المركب حيث يمكن من رؤية الاشياء التى لا ترى بالعين المجردة وهو يستخدم بكثرة فى المعامل الطبية ومختبرات المدارس
المجهر التشريحى ويعطي صورة ثلاثية الابعاد وتصل قوة تكبيره الى 300 مرة ويستخدم لمعاينة الحشرات والانسجة الكبيرة نسبيا
المجهر الالكترونى وهو ادق انواع المجاهر ويستخدم لرؤية مكونات الخلية الداخلية
