محاكم التفتيش هي سلطة كنسية (تابعة للكنيسة) قضائية استثنائية وضعها البابا غريغوري التاسع في القرن الخامس عشر و استمرت الى القرن السادس عشر , و كان الهدف منها اكتشاف مخالفي الكنيسة و معاقبتهم . كانت تحارب السحر و الشعوذة و الردة , أما في أسبانيا فكانت تحارب بالاضافة الى ما سبق المسلمين المتحولين عن دينهم و اليهود , و لهذه المحاكم سمعة سيئة و تاريخ دموي و قد الغيت في القرن التاسع عشر و استبدلت بالمجمع المقدس لشؤون العقيدة و الايمان في الفاتيكان