يتمثل الفارق بين الخلايا البدائية النواة و الخلايا حقيقية النواة في أن :
الخلايا بدائية النواة :
لا تحتوي على أنوية حقيقية
غير محاطة بأي أغشية للمادة الوراثية
غير منتظمة في نواة مغلقة أو أغشية عضيات
و أمثلة عليها خلايا البكتريا
و ذلك على عكس الخلايا حقيقية النواة :
بها أنوية حقيقية
محاطة بأغشية مادة وراثية
المادة الوراثية فيها محاطة بغشاء داخل النواة
أغشية العضيات فيها باغشية
و أمثلة عليها خلايا النباتات و الحيوانات
