لا يستطيع انزيم البيسين العمل بدون حمض الهيدروكلوريك وذلك لان حمض الهيدروكلوريك يخلق وسطاً حمضياً يساعد على تحويل الببسينوجين إلى إنزيم الببسين النشِط مما يساعد علي هضم البروتينات في المعدة بشكلٍ جزئيٍ من خلال تحويلها إلى وحداتٍ أصغر تُسمى ببتيدات (بالإنجليزية: Peptides)، والتي يتمّ امتصاصها فيما بعد من الأمعاء إلى الدم، أو يتمّ تحليلها بشكلٍ أكبر بواسطة إنزيمات البنكرياس.
