يمكن ترتيب المصادر والمراجع بعدة طرق منها:
الترتيب حسب النوع، أى مصادر هذه المراجع ، الكتب ثم الدوريات ثم الوثائق الرسمية ثم الدراسات والأطروحات.
وهناك طرق أخرى منها: الترتيب الأبجدى، الترتيب حسب تاريخ الإصدار، الترتيب حسب مكان ذكر المرجع فى البحث، الترتيب من المراجع العربية إلى الأجنبية.