مشاكل جهة سوس ماسة درعة هي :
- التدهور في الموارد المائية
- نقص المياه
- تسرب الملوحة البحرية
- تلوث المياه السطحية والمياه الجوفية بسبب المقذوفات الصناعية واستخدام المبيدات والأسمدة فى الزراعة
- تدهور الموارد الغابوية بسبب الرعي الجائر
- حرق الحطب واستخدامة في الطبخ والتدفئة
- الاراضي الزراعية والمراكز الحضرية توسعت على حساب الملك الغابوى مما ادي الي إتلافها
- التصحر وزحف الرمال
- انجراف التربة في المناطق العلوية التي ادت الى توحل السدود
- تسببت الأنشطة الصناعية والأنشطة المينائية فى نفايات سائلة وصلبة وغازية التي تهدد البيئة وادت الى تدهور البيئة الساحلية
- انتشار المساكن الغير قانونية والمغارات على طول الساحل مما ادي الي اثر على نشاط السياحة الشاطئية