يوجد نهر جوبا بجنوب الصومال، ومنبعه هو منطقة توجد بالحدود مع أثيوبيا، ويتقابل كلا من نهر داوا وجانالي ويتدفقان مباشرة في الجنوب إلى المحيط الهندي، ثم يتفرقان عند الوصول الي منعطف غوبفاين، وطول نهر جوبا يبلغ حوالي 1808 كيلو متر 804 كيلومتر منها توجد بإثيوبيا و1004كيلو متر منها توجد بالصومال
