هناك أسباب عديدة وراء اختفاء أو جفاف عدد من البحيرات، أولها التدخل البشري السيئ، وأيضًا بسبب تحويل مجاري المياه أو سوء إدارة مصادر المياه ما يحرم البحيرات من الكميات الكافية لها، بالإضافة إلى التغييرات المناخية والاحتباس الحراري، والأمثلة على ذلك كثيرة، كجفاف بحر آرال وهو بحر داخلي يقغ في آسيا بين دولتي كازاخستان وأوزباكستان، وبحيرة أورميا وهي بحيرة مالحة تقع في الشمال الغربي لإيران.