قارن بين المجهر الضوئي والمجهر الالكتروني
المجهر الضوئي أبسط وأسهل استخدامًا من المجهر الإلكتروني. التكلفة، فالمجهر الضوئيّ أبسط وأقل ثمنًا مقارنةً مع المجهر الإلكتروني الذي يعد باهض الثمن. نوع الإشعاع، فالمجهر الضوئي يستخدم الطول الموجي بين ٤٠٠-٦٠٠ نانوميتر، في حين أنَّ المجهر الإلكترونيّ يستخدم حزم من الإلكترونات طولها الموجي ١ نانوميتر. المجهر الإلكتروني له دقة أعلى بكثير من دقة المجهر الضوئي. للمجاهر الإلكترونية القدرة على إعطاء صورة أكثر تفصيلًا للأشياء مقارنةً مع المجهر الضوئي. الفرق بين المجهر الضوئي والمجهر الإلكتروني الأبرز أنَّ الإلكتروني يُظهر الصور ثلاثية الأبعاد، في حين أنَّ المجهر الضوئي يُظهر الصور ثنائية الأبعاد فقط. عملية معالجة العينات عند رؤيتها بالمجهر الإلكتروني تتطلب أمور أكثر تعقيدًا بالمقارنة مع معالجة العينات عند رؤيتها بالمجهر الضوئي. يمكن مشاهدة الأشياء بالمجهر الضوئي مباشرة بالعدسة، أمّا المجاهر الإلكترونيّة فتتطلّبُ استخدام لوح فوتوغرافي أو شاشة إلكترونية؛ وهذا لأنَّ العين البشرية غير قادرة على رؤية الإلكترون مباشرة. اختلاف القدرة على التكبير، فالمجهر الإلكتروني له قدرة على تكبير الأشياء أكثر من مئة مرة مقارنة مع المجهر الضوئي. لا يمكنُ رؤية أيّ مادة حية بالمجهر الإلكتروني على عكس المجهر الضوئي. اللون، نظرًا لأنَّ المجاهر الضوئية تستخدم الضوء المرئي فيمكن رؤية الصورة بالألوان المرئية العادية، أما المجهر الإلكتروني فتعطي صورة باللون الرمادي وبكفاءة أعلى. الحجم، فالمجهر الضوئيّ حجمُه أصغر بكثير من حجم المجهر الإلكتروني. يحتاج استخدام المجهر الإلكتروني إلى خبرة عالية، على العكس من المجهر الضوئي سهل الاستخدام والذي يتم تعليم الطلبة بالمدارس والجامعات على استخدامه
